Costruita a metà del 1500 venne dedicata a Santa Maria delle Grazie nel 1600. Si presenta con un portone al di sopra del quale, in una piccola lunetta, sono raffigurati una madonna con Bambino, San Francesco e San Michele Arcangelo.
Due targhe commemorative, poste dalla città di San Giovanni Rotondo, ricordano il 10 agosto del 1910 (ordinazione sacerdotale di San Pio) e l’anno 1916 (arrivo del frate al San Giovanni Rotondo).
All’interno si notano subito l’altare di San Francesco, utilizzato da Padre Pio per le celebrazioni, il crocifisso davanti al quale ricevette le stimmate – posizionato al piano superiore – e il confessionale in cui passava intere giornate ad ascoltare e confortare tutti i suoi fedeli.
